Kiểm soát ô nhiễm là vấn đề rất quan trọng đối với tất cả mọi khía cạnh trong sản xuất dược phẩm. Cần phải có việc kiểm nghiệm để đảm bảo rằng không khí là đúng tiêu chuẩn, các nhân tố tạo cơ hội để ô nhiễm không có (như các đọng nước trên sàn) và sự ô nhiễm từ con người được giảm thiểu đến mức nhỏ nhất có thể.
Một số cách khác để kiểm soát sự ô nhiễm:
● Không khí đi vào phòng sạch từ bên ngoài cần được lọc để loại bỏ bụi, không khí bên trong được tái lưu thông liên tục qua các bộ lọc HEPA. Điều này được kiểm soát thông qua thống HVAC (Hệ thống sưởi, điều hòa và điều hòa không khí). Phần quan trọng nhất của quá trình này là lọc không khí qua bộ lọc HEPA (Bộ lọc hiệu suất cao).
● Nhân viên ra vào cần phải đi qua Chốt gió Airlock và mặc đồ bảo hộ lao động như mũ, khẩu trang, găng tay, ủng và quần áo che kín mặt.
● Thiết bị bên trong phòng sạch cần được thiết kế nhằm giảm ô nhiễm đến mức tối thiểu. Thậm chí cây lau nhà và dẻ lau sử dụng cũng những dụng cụ chuyên dụng cho phòng sạch. Nội thất phòng sạch cũng được thiết kế để tạo ra ít hạt bụi và dễ làm sạch nhất có thể.
● Các vật liệu thông thường như giấy, bút chì và vải làm từ sợi tự nhiên không được đưa vào phòng sạch đặc biệt các khu chiết rót vô trùng.
● Một số phòng sạch được giữ ở mức áp suất không khí cao hơn để nếu có bất kỳ rò rỉ nào, không khí sẽ thoát ra bên ngoài thay vì bị không khí bẩn tràn vào phòng sạch.
● Hệ thống HVAC trong phòng sạch cũng kiểm soát độ ẩm xuống mức thấp, do đó cần có các biện pháp phòng ngừa bổ sung để ngăn ngừa phóng điện tĩnh điện.
Việc kiểm soát ô nhiễm cũng yêu cầu nhân viên phải thực hành các kỹ thuật vô trùng, mặc quần áo được thiết kế đặc biệt, để làm sạch các khu vực theo đúng tiêu chuẩn và làm việc theo hướng dẫn để giảm tối thiểu việc gây ô nhiễm.
